Conocidos los campeones provinciales de la región, estos participarán de la Etapa Departamental de la Copa Perú 2019, para lo cual se realizó la programación de cotejos en su primera y segunda fecha.
En la primera etapa, los participantes jugarán divididos en 6 grupos conformados por 4 y 3 equipos, en la modalidad de todos contra todos y en partidos de ida y vuelta. Solo el campeón y subcampeón de las series A, B, D, E, y los campeones de las series C y F, pasarán a la segunda fase.
En esta, los 10 equipos clasificados jugarán también partidos de ida y vuelta, accediendo a la tercera fase solamente los ganadores.
Así, los mejores 5 equipos jugarán en la modalidad de todos contra todos, de manera que el campeón y subcampeón representen al departamento de Puno en la Etapa Nacional de la Copa Perú.
